“国宝”中华鲟野生种群目前正面临着种群数量减少、生态环境变化等问题而难以繁殖。有研究表明，长江水体污染导致中华鲟幼鱼畸形和性别失调，使其自然繁殖难度进一步加大。
2014年11月至12月，中国科学院水生生物研究所、中国三峡集团中华鲟研究所、中国水产科学研究院、水利部中科院水工程生态研究所对中华鲟自然繁殖情况展开了监测，结果令人失望，他们没有监测到野生中华鲟的自然繁殖活动。这是继2013年首次确认中华鲟未进行自然繁殖后，连续第二年没有发现中华鲟进行自然繁殖活动。
“应该说我们面临的情况非常复杂，各种因素来自各个方面。”三峡集团中华鲟研究所副所长高勇表示，野生中华鲟目前面临繁殖困难，主要有三个方面的原因，一是种群数量减少，二是雌雄性比失调，三是长江流域生态环境变化。
有权威研究表明，长江水质的污染对中华鲟亲鱼的性腺发育、自然繁殖受精卵的孵化和幼鲟的发育都带来了巨大影响。
研究显示，长江沿岸城市生活污水和工厂排污，导致鱼类代谢障碍；印染等企业排放的高分子有机物，引起了水生生物癌变、畸形和基因突变。有科学家发现，长江野生中华鲟的鱼卵中含有TPT(三苯基锡)，浓度足以使幼鱼致畸。2001年后，科研人员不断在长江发现躯体畸形和无眼的中华鲟幼鱼。
与此同时，受环境变化影响，野生中华鲟雌雄性别比例一路走高。数据显示，2005年中华鲟的雌雄比例达到7.40:1，目前已接近10:1。这意味着，即便雌鱼产下大量卵子，也无法受精繁殖。
